肾结石的治疗方法有口服排石药物治疗、体外冲击波碎石治疗、输尿管软镜碎石治疗、经皮肾镜碎石治疗、肾盂切开取石术、肾实质切开取石术等。输尿管结石的治疗方法有：口服排石药物治疗、体外冲击波碎石治疗、经尿道输尿管镜碎石术、经皮肾镜碎石术、腹腔镜输尿管切开取石术、开放输尿管切开取石术等。膀胱结石的治疗方法有：内腔镜手术，开放性手术和体外冲击波碎石等。尿道结石的治疗需要根据尿道结石的大小、形态、部位、尿道局部病变，以及有无并发症等情况而决定。有自行排石、尿道内注入润滑剂协助排石、尿道内原位或推入膀胱内行腔内碎石等多种方法。