白色念珠菌感染部位、方式和严重程度不同，患者自身免疫力不同，进行治疗时选择药物、用药方式和疗程也不尽相同。皮肤的白色念珠菌感染一般采取经验治疗，通常使用吡咯类的药物，相对安全且有效。系统性的白色念珠菌感染患者，应根据念珠菌的药敏试验结果和感染部位来选择药物，常用治疗系统白色念珠菌感染药物有三唑类，如氟康唑、伊曲康唑，棘白菌素类、多烯类，如两性霉素B及其含酯的复方制剂和复方磺胺嘧啶。一般来说部分皮肤和黏膜的白色念珠菌病可选择局部用药，将抗念珠菌的药物软膏、霜剂等涂于病变的皮肤黏膜，也可将栓剂、洗剂等用在患病的泌尿生殖道。对于局部用药没有效果的皮肤黏膜念珠菌病和部分黏膜系统性念珠菌病，可选择全身用药，包括口服或静脉滴注，不同部位感染，治疗疗程也各有不同，应遵循医生指导，按规律足疗程的用药，不可擅自断药、停药。