咳嗽腰疼的原因，有可能是咳嗽时造成了腰部出现了肌肉拉伤或者伴有炎症的现象，这种情况腰痛可以应用非甾体类的消炎止痛药物控制疼痛。也有可能是病原体感染，引起反复咳嗽，可以引起急性肾炎的现象，会出现咳嗽腰痛的情况，这种情况需要针对细菌感染应用抗生素控制感染治疗，需要针对急性肾炎选择应用肾上腺糖皮质激素等药物治疗。