盆腔炎性疾病病原体有外源性及内源性两个来源，两种病原体可单独存在，但通常为混合感染，可能是外源性衣原体或淋病奈瑟菌感染造成输卵管损伤后，容易继发内源性需氧菌及厌氧菌感染。外源性病原体主要为性传播疾病的病原体，如沙眼衣原体、淋病奈瑟菌，其他有支原体，包括人型支原体、生殖支原体，其中以生殖支原体为主。内源性病原体来自原寄居于阴道内的微生物群，包括需氧菌及厌氧菌，可以仅为需氧菌或仅为厌氧菌感染，但以需氧菌及厌氧菌混合感染比较多见。