肛门息肉大多需手术治疗。对于非息肉病的直径小于2cm的有蒂息肉，可行经肛门的切除术或行内镜下圈套摘除、活检钳钳除、高频电凝凝除。对直径大于2cm的广基息肉，需要根据临床实际情况选择合适手术方案，比如经肛门手术、经腹手术、内镜黏膜下剥离术、经肛门内镜下的息肉切除术、经肛门括约肌途径的切除术。有些在术后有复发的几率，可能需要多次手术治疗。