肛周脓肿手术后一般需要使用抗生素以及外用药物来进行治疗。抗生素常常选用头孢类抗生素或者是青霉素类抗生素等，例如头孢呋辛、头孢他啶，有时也需要使用抗厌氧菌药物，例如甲硝唑、奥硝唑、替硝唑等。外用的药物有很多种，例如稀释过的温高锰酸钾水，或者是碘伏溶液，或者是中药制剂等，有时需要涂擦，有时需要进行坐浴治疗。在手术后，患者应避免饮用含有酒精的饮品，不要吃辛辣食物。如果患者有明显疼痛，还可以口服止痛的药物，例如布洛芬缓释胶囊等。