引起飞蚊症的原因主要有两大类：一类是生理性的飞蚊症，另一类是病理性的飞蚊症。生理期飞蚊症主要是由于先天性的玻璃体变性，或者是老年性玻璃体液化变性，玻璃体后脱离所引起的。而病理性的飞蚊症有两个因素，一个是眼部的因素，一个是全身的因素，眼部的因素包括高度近视，葡萄膜炎，眼内炎，眼部的肿瘤，眼外伤等等引起的玻璃体混浊变性，玻璃体出血，玻璃体腔内的团块肿块等等引起的飞蚊症。而全身的因素，比如高血压，糖尿病等引起的视网膜病变，玻璃体出血，也是造成飞蚊症的重要的原因。