患有肾脏囊肿以后处理的方法因囊肿的大小而不同。1、对于体积小的肾脏囊肿，并不需要药物治疗，也不需要手术治疗，只需要定期到医院门诊进行肾脏超声的随访，主要是观察囊肿是否进一步增大，是否存在囊肿破裂、出血、感染等等，平常要注意不要挤压和碰撞腰部。2、如果肾囊肿直径大于4厘米以上，伴腰痛，可以选择在超声引导导下进行囊肿穿刺，抽出囊液以后，再向囊腔中注射硬化剂；有些患者也可以选择外科手术治疗，这些治疗方法疗效比较好。