一个女性后腰两侧肾区疼痛的原因，需要分析肾区的器官组织，才能得到良好的鉴别诊断。肾区具有皮肤、腰肌、骨骼以及肾脏和输尿管，如果皮肤出现了病变，例如炎症、外伤、蚊虫叮咬或者某些带状疱疹，可以出现疼痛的感觉，这时候从皮肤外观上很容易进行鉴别诊断。如果腰肌出现了损害，最常见的就是腰肌劳损，在体位改变的时候，可以加重或者减轻。排除了皮肤和肌肉的病变，有可能是腰部腰椎的病变，出现了椎间盘突出和骨质增生，这时候做X光片可以进行确诊，在弯腰提重物的时候可以加重。排除了皮肤、肌肉以及骨骼的病变，最多考虑的就是肾脏和输尿管或者病变。如果存在疼痛就需要考虑是否出现感染、出血、肾脏积水或者结石的情况，需要做泌尿系统彩超来进行确认。