肛门有小疙瘩，可能是感染因素、过敏反应、皮脂腺囊肿等原因引起的。1.感染因素包括细菌、病毒感染。如果平时不注意肛门局部卫生，容易滋生大量细菌，引起炎症反应，形成突起疙瘩，可能伴有瘙痒。2.也可能是病毒感染，如果有不洁性生活史感染人乳头瘤病毒会形成菜花状、鸡冠状的小肉疙瘩突起，形成肛门尖锐湿疣，此病属于性传播疾病。3.过敏反应也可引起肛门有小疙瘩。通常见于过敏性体质人群由于接触了过敏原，引起肛门皮肤形成疙瘩突起伴有瘙痒。4.肛门周围皮肤有较多皮脂腺，排泄管发生堵塞时可形成囊性肿物，诱发皮脂腺囊肿。体积比较小，引起肛门有小疙瘩。