尿液当中鳞状上皮细胞偏高有可能是存在慢性肾盂肾炎引起的，也有可能是慢性膀胱黏膜病变引起的，需要通过进一步检查，包括尿常规、尿培养、膀胱镜检查明确诊断。如果是慢性肾盂肾炎选择敏感抗生素，比如呋喃妥因片、磺胺嘧啶片持续口服治疗三周以上，清除泌尿系统当中的致病微生物，炎症才能得到有效的控制，同时也可以配合口服一些清热利湿的中成药，比如三金片、热淋清胶囊也有很好的辅助治疗效果。如果通过检查明确是由于慢性的膀胱黏膜炎症导致这种情况发生需要通过手术治疗，比如经尿道膀胱黏膜电切手术，把病变黏膜去除以后，尿液的鳞状上皮细胞才会消失。