目前临床医学中针对于患者口腔菌群失调的这种情况主要的治疗方法就是采用药物进行治疗，而且由于患者的口腔出现菌群失调一般都是由于长期性的应用抗生素使得人体的免疫力出现混乱的情况，所以说患者在采用药物的基础治疗的同时，一定要注重生活方面的护理。比如多吃一些营养比较丰富的食物，适当参加一些体育训练。选择比较利于口腔健康的牙膏，注意不要使用药物类型的牙膏，这种类型的牙膏可能会加重菌群失调，然后养成科学健康的口腔清洁的习惯。