多发的肾结石治疗方法一般需要通过手术来进行治疗。临床上常用的方法是经皮肾镜碎石，取石手术。手术的方式是在患者的腰部建立通道一般通过超声引导下进行经皮肤穿刺进入到肾盂内，然后将通道扩张，置入肾镜，通过钬激光或气压弹道，或者是超声来打碎结石，将小石块通过水流冲出体外，从而达到治疗肾结石的目的。也可以通过腹腔镜手术来进行治疗，通过腹腔镜下将肾盂切开，将肾盂内的结石取干净，然后再进行缝合，也能达到治疗的目的。