射精疼痛有可能是以下几种原因：1.射精太过于频繁。如果个人平时手淫或性生活次数太多，有可能会造成局部长时间充血，毛细血管以及尿道的粘膜都有可能会因为长时间充血而变得较为敏感。在此时射精刺激收缩就有可能会引发疼痛感。2.泌尿系统疾病。如果有存在尿道炎，前列腺炎以及精阜炎等等疾病，都有可能会出现射精疼痛。在这些疾病没有治疗好之前，尽量还是不要性生活为好的。3.结石。如果有存在尿路结石等疾病，则射精的时候局部抽搐可能会导致结石受到挤压，也就有可能会造成疼痛的。