肠结核是由于感染了结核分歧杆菌而引起的肠道慢性，特异性的疾病。通常结核分歧杆菌侵犯肠道，主要是经口传播。患者多有开放性的肺结核，因为经常吞咽含有结核分枝杆菌的痰液而引起本病。其主要位于回盲部，即回盲瓣和相邻的回肠和结肠，通常肠壁的淋巴组织可以充血水肿，以及炎症渗出，进一步发展为干酪样的坏死，随后形成溃疡。溃疡的深度可深达肌层或者浆膜层。