在医生的指导下服用清浊祛毒丸主要治疗以尿频、尿急、尿痛为主要症状的急慢性尿路感染，服用时应该按照急性炎症、慢性炎症等不同病症，在医生的指导下服用，切忌自行盲目服用药物，服用时多喝水，坚持按疗程服用，如果出现任何不适需要立即停药去医院就诊。同时，若患者泌尿生殖系统炎症同时出现其他症状时可在服用清浊祛毒丸时加服其他中成药，例如若患者兼具神疲乏力、头晕目眩、易感冒等症状，考虑为气虚，可加服补中益气丸等。