在囊肿较小时，大多可以通过抗炎镇痛药物进行治疗，包括口服抗炎类药物来促进局部炎症的缓解，加速血液的流通，达到治疗腱鞘囊肿的作用，当囊肿较大时，由于囊肿较大，局部炎症较重，出现了疼痛酸胀感，同时较大的囊肿影响了关节的活动，大多需要进行手术切除，所以手上有腱鞘囊肿的，治疗方案主要取决于囊肿的大小，囊肿发生部位，对关节活动度的影响，从而决定具体的治疗方案。