胃神经官能症的治疗主要是以缓解症状，防止复发，改善生活质量为主。要帮助患者认识，理解病情，改善生活习惯，避免烟酒，咖啡及非甾体类消炎药，避免个人生活经历中会诱发症状的食物，尽量少食多餐，避免一次大量进食。药物治疗上主要是给予对症治疗，可以选择促胃肠动力药，如多潘立酮，莫沙必利，伊托必利及西尼必利等改善与进餐相关的上腹部症状，可缓解腹胀，早饱，嗳气等症状，少数患者有腹鸣、稀便或腹泻、腹痛等不良反应，减量或使用一段时间后不良反应可减轻。质子泵抑制剂和选择H2受体阻滞剂适用于非进餐相关消化不良中上腹痛，烧灼感为主要表现的症状。如果常规对症治疗效果不好，可以选择抗抑郁和焦虑药物进行治疗。