复方甲硝唑阴栓多久排干净，需根据患者个体情况而定，部分患者药物充分吸收，没有残留排出或者排出较少，部分患者可能在几个小时内排出部分药物。一般上了阴道栓剂后，如果上到阴道后穹窿，局部能够充分的溶解吸收，排出来的就很少或者没有，这说明完全溶解吸收掉了。而部分患者因为上药的部位不是最恰当的，或者上药后尽早的下床活动，就容易在几个小时内而排出来。所以患者建议上药后至少平卧半小时，最好能够平卧两个小时。而且要上到阴道后穹窿，也就是一个手指头深度以上，这样就避免药物排出，达到药物的最佳吸收效果。使用该药物的患者应注意，对复方甲硝唑阴道栓或吡咯类药物过敏患者，以及有活动性中枢神经疾病和血液病患者禁止使用，使用中若出现过敏症状或中枢神经系统不良反应，应立即停药，肝、肾功能减退者应慎用。