药物治疗是结核病治疗的基石，相比其他类型细菌感染，肺结核治疗可能需要更长的时间。对于活动性肺结核，需要服用抗结核药物至少6~9个月，具体药物和治疗时间取决于患者的年龄，整体健康状况和耐药情况等。化疗是肺结核最主要的基础治疗手段，其目标不仅是杀菌和防止耐药性的产生，还包括最终灭菌，防止和杜绝复发肺结核复发。原则为早期、规律、全程、适量、联合。常用药物包括异烟肼，利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇等。