胃肠功能紊乱的治疗主要是药物治疗。胃肠功能紊乱后表现出的临床症状各有不同，需要针对患者的具体症状，采取个体化的药物治疗。如果患者疾病发作时表现出剧烈的腹部疼痛，主要是由于胃肠道痉挛引起的。需要使用解痉止痛的药物进行治疗，常用的药物包括阿托品和颠茄片等。如果患者出现明显的腹胀症状，考虑与消化不良有关，需要使用促胃动力药奥沙必利或多潘立酮治疗。如果出现明显的便秘症状，可以使用乳果糖等药物治疗，腹泻时可以使用蒙脱石散治疗。