咳嗽时头疼的原因常见如下：第一、受到细菌或病毒引起的上呼吸道感染，可导致鼻源性头痛，比如鼻炎和副鼻窦炎等，在咳嗽时会引起头疼。第二、人体在剧烈咳嗽时，会刺激到胸膜部压力发生变化，导致头部血供急剧出现变化，影响到头部的血液循环，从而发生头痛表现。第三、各种原因引起的颅内高压，会导致患者出现剧烈的咳嗽和头痛以及呕吐等表现。患者发生上述症状时，建议停止运动适当休息，如果症状不能缓解，要及时到医院就诊。