结膜炎滴眼药水刺痛多数考虑为正常现象，由于在滴眼药水的同时对眼部是种异物进入，在使用的过程中有轻微刺痛感，但是只是一过性，稍微适应后症状会得到减轻或者消失。尤其是结膜炎的患者处于发作状态，正有充血、水肿的症状，比较敏感，所以刺痛感会加重。也有可能是药物的不良反应，如对药物过敏刺痛的症状不仅不会减轻，反而会非常的明显且加剧，需及时停止用药或者是更换其他药物。