直肠隐隐作痛，首先是考虑有直肠炎，或者是肛窦发炎的情况。另外也不排除有直肠息肉，或者是直肠肿瘤等增生性质的疾病存在。1、直肠黏膜组织如果发生了充血、水肿、糜烂等病理性的改变，就可能会导致直肠的隐隐作痛。2、肠息肉、肠道肿瘤等增生性的疾病，发生了溃烂或者是出现了炎症反应的，也可以表现为直肠的隐隐作痛。3、一些感染性质的疾病，比如直肠黏膜下的脓肿，或者是肛管直肠间隙的脓肿，在脓液尚未形成时，也可以发生直肠隐隐作痛的情况。此时可以到肛肠科进行就诊，主要是通过药物治疗或者是手术治疗。