意外怀孕后如果服用了药物，建议通过下列几种方式处理：1.暂停用药。孕妇在发现有怀孕的情况发生后，应当首先暂停用药。如果服用药物，是因为身体仍然存在不适症状，应当咨询医生确定药物，是否可以继续在怀孕期间服用。2.在怀孕35~40天，到医院进行相关检查。例如B超检查或者血液HCG等检查，确定胚胎的发育是否正常，是否有正常的胎心或者是胎芽等。如果胚胎的情况正常，考虑并没有受到药物的不良影响，继续正常妊娠，加强孕期的监测即可。