卵巢萎缩的治疗方法有：1.可以在医生的指导下服用一些雌激素的药物，常用的药物有补佳乐、黄体酮胶囊等。2.如果是因为卵巢血管因素导致卵巢萎缩，需要及时的进行手术治疗。3.如果是因为肾上腺皮质功能低下导致的卵巢萎缩，可以使用皮质醇进行治疗。4.平时还需要多吃些豆制品，这样能够及时的补充女性身体内所需要的雌激素。5.平时可以还可以对盆腔进行理疗，常用的方法有热敷、艾灸、红外线烤灯等，这样可以促进卵巢处的血液循环，有利于卵巢功能的恢复。