到目前为止，尚不能明确强直性脊柱炎的病因，但是临床上都认为与遗传，感染，免疫，环境等因素相关。遗传方面研究发现，强直性的脊柱炎，具有明显的家族聚集性，根据流行病学显示，强直性的脊柱炎患者中，HLA-B27基因的阳性率超过90%，感染因素，据报道，强直性脊柱炎患者中溃疡性结肠炎和局限性肠炎的发生率较普通人群高，因此感染是可能会导致强直性脊柱炎发生的，免疫性因素也会导致强直性脊柱炎的发生。