婴儿秋季腹泻的治疗措施主要是调整饮食、进行肠道菌群的调节以及保护肠道黏膜，必要时服用药物促进肠道黏膜的修复。饮食方面辅食尽量由少到多、由稀到稠，必要时使用去乳糖的配方奶进行喂养，避免继发乳糖不耐受，从而出现腹泻加重。药物方面主要是根据腹泻的严重程度而定。轻微的腹泻主要是服用肠道益生菌以及肠道黏膜保护剂。但是如果是严重的腹泻，建议服用抗分泌的药物以及锌剂进行治疗。婴儿秋季腹泻容易发生脱水以及电解质紊乱，应尽量鼓励宝宝多喝口服补液盐或者是水，预防并发症的发生，促进疾病恢复。