肾肉芽肿的治疗需要看引起肉芽肿的原因，进行对因治疗，治疗方法包括抗生素及抗厌氧菌药物、手术切除治疗等，具体如下：1、抗生素及抗厌氧菌药物：如果是感染因素所导致，需要规律给予抗生素进行治疗，常用的药物有头孢类抗生素或者是青霉素类抗生素等，有时还需要配合使用抗厌氧菌药物，例如甲硝唑、奥硝唑、替硝唑等；2、手术切除：如果是由于异物刺入所导致，需要完善相关检查，在麻醉状态下进行异物及肉芽肿的切除，然后再进行缝合，后期给予规律换药，该疾病即可得到治愈。