肛门如果有水泡，首先还是要排除是不是有痔疮的形成。另外，也要排除是不是痔疮有发生水肿的情况。同时也要排除是不是肛周脓肿的可能。还是建议患者先去当地三甲医院的肛肠科明确一下诊断，诊断明确以后主要治疗的方法，还是以药物的对症治疗为主。可以先进行药物的保守治疗，使用中药进行坐浴和熏洗，使用药膏和药栓塞入到肛门里面进行治疗。经过了规范系统的药物保守治疗，效果不理想，就可以考虑通过手术等方法进行治疗。