慢性疲劳综合征是一种自限性的疾病，许多人能在两周内靠自身免疫力，不用任何治疗而康复。也可用药物进行治疗，但药物治疗的效果是有限的，止痛药可以缓解头痛等症状，抗抑郁药可以帮助睡眠、改善心情状态。营养和运动是治疗的要点，可以进行少量的活动，避免运动过度。禁用阿司匹林，因为它可以引起雷诺氏病等疾病。另外为了增强免疫系统的功能和加快康复，可以多吃包括蔬菜水果，全麦等谷类，种子，核果以及去皮的火鸡肉，深海鱼类，用来强化免疫力。