男性尿液有异味病理性因素可能是有泌尿系统或者膀胱系统、肾脏系统的疾病导致的，生理原因可能是饮水量少导致的。当患者有尿道结石、膀胱结石容易引起结石划伤尿道或膀胱壁，从而引起炎症的现象。就会使尿液中的蛋白质、分泌物以及其他杂质出现增多的现象，就容易使尿液出现有异味的现象。当肾脏系统出现了疾病，容易引起肾小球的过滤功能减弱。就会造成对体液过滤不全引起尿液中杂质比较多的现象，也容易使尿液有异味。另外，当天气比较热、出汗比较多，但是水分摄入量比较少，就会引起尿液浓缩，从而导致气味比较大的现象。