引起肾囊肿的原因，主要有以下三种：1.和遗传基因病变有关系，就是临床上最常见的多囊肾，可以分为常染色体显性遗传性肾囊肿和常染色体隐性遗传性肾囊肿。其中，显性遗传者的病变基因位于16号和4号染色体，隐性遗传者的病变基因位于6号染色体，这类患者容易出现肾功能衰竭。2.与肾小管退行性变有关，随着年龄增长，肾小管憇室会越来越多，这些肾小管憩室最终将变成肾囊肿。3.与血液透析有关，多见于血液透析3年以上的尿毒症患者。