巧克力囊肿，也称为卵巢子宫内膜异位囊肿，是指卵巢上出现了子宫内膜组织。这种子宫内膜组织出现的原因目前尚不完全清楚，有可能是由于宫内的子宫内膜由输卵管逆流至卵巢表面种植，也有可能是由于卵巢表面的上皮组织受到了卵巢激素或者经血慢性炎症的反复刺激后，激活了，且化生，转变为子宫内膜样组织。这种子宫内膜囊肿有可能随月经周期逐渐增大，然后出现破裂的情况，囊液流入腹腔也有可能引起腹痛以及盆腔内的炎性粘连，对女性以后的生育能力也会造成一定的影响。