巧克力囊肿是比较严重的妇科疾病，它主要会引起痛经和不孕症。所以准备怀孕的女性通常是需要积极治疗的。巧克力囊肿是子宫内膜异位的一种，他的病因并不是很明确，初步判断多与体内激素水平异常有关系，还有可能是有遗传因素。再有就是平常经常服用避孕的药物，也可能会影响。最近的研究考虑也有可能是自身免疫性疾病，不过治疗起来也是比较漫长的，并且要经过打针，过程也是比较痛苦的。