三叉神经痛分为继发性三叉神经痛和原发性三叉神经痛。继发性三叉神经痛都有明确的病因，比如颅内肿瘤、脑膜炎、脑干梗死，或者是多发性硬化等等。原发性三叉神经痛，病因一般都是不明确。现在有很多的学者认为，原发性三叉神经痛是由微血管压迫神经导致的，也有学者认为是病毒感染导致的，但具体病因有待进一步的研究。