怀孕咳嗽厉害，这种情况很可能是属于炎症感染的原因造成的，可能是病毒性的感染，也可能是细菌性的感染。因此需要查明病原体，针对病原体应用药物治疗。如果是属于病毒性的感染，不可以选择西药抗病毒的药物治疗，只能是选择应用中成类抗病毒的药物，控制病毒复制和繁殖治疗。如果是属于细菌性的感染，需要选择应用青霉素类的抗生素或者头孢菌素类的抗生素控制感染治疗。