3个月的宝宝患上百日咳通常需要使用抗生素来治疗，比较常用的药物有氨卡西林、红霉素、阿米卡星等。同时还需要进行呼吸道隔离，控制感染。也可以配合雾化治疗，这样有助于缓解咳嗽。孩子患上百日咳后需要积极进行治疗，因为这种疾病发展严重很容易引起并发症，比如会导致肺炎或者是心血管系统障碍以及百日咳脑病，对孩子身体健康危害较大。举措建议在疾病治疗期间要认真做好对宝宝的护理工作，比如要注意给宝宝保暖，避免受凉。如果宝宝是母乳喂养，妈妈在饮食上也要清淡，避免油腻辛辣的食物，可以适当多吃一些新鲜的水果和蔬菜。平时还要保持室内空气流通。