引起飞蚊症的原因可以分为两大类：第一类叫生理性飞蚊症，主要是由于先天性玻璃体变性，或者是老年性玻璃体液化变性，玻璃体后脱离所引起的。第二类叫病理性飞蚊症，常见的原因包括眼部的原因和全身的原因。眼部的原因，比如高度近视、眼内炎、葡萄膜炎、眼部肿瘤等等所引起的玻璃体的变性、混浊、出血，以及玻璃体腔内的一些团块、肿块，都可以引起飞蚊症。全身的因素包括高血压、糖尿病等引起的视网膜病变，玻璃体出血也容易造成飞蚊症的感觉，甚至引起视网膜牵拉导致视网膜脱离。