巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种。正常情况下，月经是通过阴道排出体外。而如果月经不经过阴道排出体外，而是通过输卵管到达卵巢，导致内膜因为受卵巢分泌功能影响会呈周期性的改变，异位到卵巢位置的子宫内膜，也随着卵巢的周期性的分泌功能的改变而呈周期性的变化，分泌的积液无法排出体外，堆积多了、久了，积液的颜色像巧克力一样。巧克力囊肿主要是子宫内膜异位于卵巢而形成的病变。巧克力囊肿对生育影响较大。因此，应早发现，早治疗。