肠功能紊乱的治疗方法如下：肠功能紊乱一般有以下几个因素，如肠道蠕动功能失常、肠道菌群失调、肠道高敏感状态等，我们一般根据患者的具体表现和诱发因素选择治疗方法，伴有腹胀者可以选择促肠动力药物如普芦卡必利分散片、四磨汤等，如粪便涂片检查提示肠道菌群失调可以补充益生菌，选择双歧杆菌、乳酸杆菌制剂等，如在情绪激动、焦虑、抑郁等不良因素基础上诱发腹胀、腹泻，可以选用药物稳定情绪，如氟哌噻吨美利曲辛片，也可以选择中医中药调理。具体用药需要专业医生指导。