多发性肾结石如果位置和大小都没有引起梗阻症状者，可以采用保守治疗，包括改变生活习惯和大量饮水，控制的饮水量每天在2500-3000mL以上，尿量达到2000-2500mL，注意饮食调节，减少高钙饮食及蛋白质饮食的摄入，防止形成尿酸结石以及其他类型的结石。同时，可以使用一些促进结石排除的药物，如噻嗪类的利尿剂、枸橼酸盐等等。一旦多发的肾结石出现梗阻症状，产生复杂性尿路感染以及导致肾功能减退者，需要采取手术治疗解除梗阻。