尖锐湿疣的治疗原则是尽可能的去除可见的疣体，并减少复发。无论用何种方法来治疗复发总是难免的，仅是复发率高低而已。哪一种办法是治疗尖锐湿疣最佳的方法，尚无定论。该选择何种办法应就患者个体而言，取决于皮损的分布部位、大小、数目、形态、治疗费用、患者的选择、方便性、副作用及医生的经验。大多数患者治疗需要一个疗程，而不是一次性的治疗。目前的治疗方法有以下几种：第一，局部药物治疗。可以用5%足叶草毒素酊，也可以外用5%的酞丁胺擦剂、5%的氟尿嘧啶软膏、5%咪喹莫特米霜，这些药物是患者自行在家中应用的。第二，在医院里可以进行局部的物理治疗，可以给予激光、冷冻、电灼这些办法来治疗。对于疣体巨大，可以给予手术切除的办法。第三，氨基酮戊酸光动力疗法。可以选择性的杀伤增生旺盛细胞，不仅对肉眼可见的尖锐湿疣皮损有破坏作用，还可清除亚临床损害和潜伏感染的组织。其治愈率高、复发率低、不良反应少且轻微、患者依从性好。第四，免疫疗法。单独使用效果不明显，可作为辅助性的治疗手段，配合以上的几种办法来治疗。可以给予干扰素、白介素－2、聚肌胞治疗。