巧克力囊肿引起的原因有可能是以下几点。一、如果在日常生活中多次进行流产手术，会导致子宫内膜受损，如果受到腹腔压力的影响下，就会导致子宫内膜碎片随着经血逆流进入盆腔，从而造成巧克力囊肿。二、如果经常在经期进行性生活，非常容易引起经血逆流，严重时就会形成巧克力囊肿。三、如果年纪逐渐增大，卵巢功能会慢慢退化，这时就会出现局部免疫功能不足的情况，所以很容易导致经血逆流进入卵巢，从而引发巧克力囊肿的发生。具体原因需要到医院进行检查后明确判断。