婴儿肠炎的发病原因比较多，包括饮食卫生、生活习惯和药物因素等。1、饮食卫生。在给婴儿喂奶的过程中，不注意饮食卫生，导致婴儿吃进大量细菌和病毒，就会造成肠道感染。如母乳喂养的婴儿在喂奶之前，母亲不注意清洁乳头，或者是人工喂养的婴儿使用的奶嘴和奶瓶不能进行定期的消毒处理，都会导致婴儿发生肠炎。2、生活习惯。对婴儿的玩具不能规范消毒，让婴儿拿着玩具玩耍的过程中，会将玩具放在嘴里，通过玩具也可以感染细菌，引起肠炎。3、药物因素。婴儿出生后滥用抗生素，导致肠道内的正常菌群被破坏，也会引发肠炎。