男性小便时刺痛与尿道感染有关，也可能与泌尿系结石有关。小便时出现了疼痛，临床也称之为尿痛，这是尿道刺激症的一个典型表现，除了与泌尿系感染有关之外，也与泌尿系的结石有关。泌尿系感染，包括急性肾盂肾炎，膀胱炎，尿道口炎以及男性的前列腺炎，这些疾病都有可能会出现尿频，尿急，尿痛的现象。输尿管下段结石由于结石的梗阻会引起尿道刺激症，这也是引起尿痛的一个最常见的原因。