怀孕时有霉菌性阴道炎在治疗上可以选择阴道给药，配合外用熏洗的药物进行治疗。患者首先要保持外阴的清洁干燥，需要用清水或专用的药物洗液，对局部进行清洗。再应用治疗霉菌性阴道炎的栓剂进行阴道给药治疗。需要注意的是在药物的选择上以及用法用量，要严格听从医生的指导应用。由于女性在怀孕期间属于特殊的时期，所以最好不要应用口服药物治疗，以免给胎儿带来不良影响。另外，在治疗期间不要吃辛辣的食物，还要注意清洁卫生。