食管疾病检查有很多方法，包括胃镜，超声胃镜，上消化道钡透，CT，食管测压，食管下段ph检查等。其中内镜检查是最主要的，可以检查出多种食管疾病，比如食管黏膜白斑，食管胃黏膜异位，食管憩室，食管平滑肌瘤，食管囊肿，食管炎，食管溃疡，食管胃底静脉曲张，食管肿瘤等。某些食管黏膜下的病变可以通过超声内镜另外加胃镜检查确诊。另外如内镜检查不准确，可以行上消化道钡透检查，可以检查出贲门失弛缓症。某些特定疾病，比如食管阴性的胃食管反流，可以通过食管下段PH检查协助诊断。