龟头流脓的原因可能是感染了细菌，建议患者一定要到医院就诊，到正规医院的男科或泌尿外科就诊，完善检查后进行相应治疗。首先应该取龟头的分泌物，做淋球菌、支原体、衣原体检查，也可以做细菌培养。然后再做尿常规检查，看看尿中是否有白细胞增多。如果有不洁性交史，建议同时进行性病的相关检查。治疗期间不可进行性行为，以免导致配偶感染。