男性支原体、衣原体常常通过分泌物检查，如病人发生支原体或衣原体引起的非淋菌性尿道炎时，病人常常会出现尿道隐痛、尿道发痒或尿道口少许分泌物。通过尿道口分泌物培养常常能发现有无支原体或衣原体感染。男性支原体、衣原体感染还可以通过精液培养来完成，通过精液支原体培养和衣原体培养常常能找到致病微生物，通过选择有效的抗生素，如盐酸多西环素、阿奇霉素分散片等序贯治疗四周左右，多数病人支原体、衣原体感染症状会彻底好转。